Adscritas al Servicio de Alimentación se encuentran tres Unidades analíticas donde se llevan a cabo determinados análisis que exigen una alta especialización, dando soporte a las unidades analíticas de producto para completar sus análisis mediante la aplicación de determinadas normas técnicas, publicaciones científicas y métodos internos basados en la propia experiencia. Las unidades que lo forman son:
- Unidad de microbiología.
- Unidad de microscopía e identificación óptica.
- Unidad de bioanálisis.